在工程领域，经常会涉及到保函和合同这两个概念，它们虽然都是为了保障合作双方的权益，但在具体的使用和功能上存在一些不同。

首先，工程保函是由银行等金融机构出具的一种担保函，主要是为了保证承包商能够按时交付工程或者履行合同中规定的义务。在很多工程项目中，业主方会要求承包商提供保函作为担保，一旦承包商未能按照合同要求履行，业主方可以向银行提出索赔，银行则会按照保函的规定进行赔偿。

其次，工程合同是由合作双方签订的一种协议，明确规定了工程项目的各项内容，包括工程的范围、价格、工期、质量标准等。合同是双方自愿达成的协议，受到法律保护，一旦任何一方违反了合同条款，都需要承担相应的法律责任。

从功能上来说，工程保函主要是为了保证合同的履行，当一方无法履行合同时，另一方可以通过保函获得赔偿；而工程合同则是双方达成协议的基础，规定了工程项目的具体内容，为工程的顺利进行提供了规范和保障。

综上所述，虽然工程保函和合同都是为了保障双方的权益，但在具体的使用和功能上存在一些区别。在工程项目中，合同和保函常常是同时存在的，合理使用这两种工具，可以更好地保障工程项目的顺利进行。